Tekst źródłowy strony TI/Pracownia wykorzystania zasobów internetowych/BIOLOGICZNE BAZY DANYCH – WSTĘP


==Wstęp==
Biologiczne i biomedyczne bazy danych to „kopalnie” informacji z dziedziny nauk przyrodniczych, pochodzących z eksperymentów naukowych i projektów wielkoskalowych, artykułów naukowych i analiz komputerowych. Zawierają m. in. dane dotyczące sekwencji, funkcji i struktury genów oraz białek, efektów klinicznych mutacji, ścieżek metabolicznych jak również podobieństw między sekwencjami i strukturami. 

Raz w roku czasopismo „'''Nucleic Acids Research'''” publikuje listę wszystkich dostępnych baz biologicznych, wraz z ich adresami internetowym i krótkim opisem bazy. W roku 2011 lista ta obejmowała 1330 pozycji ([http://www.oxfordjournals.org/nar/database/c/ http://www.oxfordjournals.org/nar/database/c/]).
==Przydatne linki==

'''ExPASy''' (Expert Protein Analysis System) &mdash; [http://www.expasy.ch/ http://www.expasy.ch/], serwer proteomiczny Swiss Institute of Bioinformatics (SIB, Genewa, Szwajcaria), współpacujący z European Bioinformatics Institute (EBI) oraz z Protein Information Resource (PIR).

'''European Bioinformatics Institute''' (EBI, Hinxton, UK) &mdash; [http://www.ebi.ac.uk/ http://www.ebi.ac.uk/], wchodzi w skład European Molecular Biology Labolatory (EMBL), jednostki wspieranej przez 16 krajów (Europa zachodnia i Izrael).

'''National Center for Biotechnology Information (NCBI, Bethesda, USA)''' &mdash; [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/], wchodzi w skład National Library of Medicine (NLM) przy National Institutes of Health (NIH). Gromadzi informacje dotyczące sekwencji nukleotydowych (w bazie [wikipl:GenBank|]]), sekwencji białkowych ('''Protein'''), artykułów biomedycznych ([[wikipl:PubMed|PubMed]]), małych cząsteczek biologicznych ('''PubChem''') a także inne informacje dotyczące biotechnologii. Wszystkie te bazy danych są dostępne w sieci przez wyszukiwarkę [[wikipl:Entrez|Entrez]].

'''International Nucleotide Sequence Database Collaboration''' &mdash; [http://insdc.org/ http://insdc.org/],
międzynarodowa baza wszystkich publicznie dostępnych sekwencji nukleotydowych oparta na współpracy między trzema bazami: '''DDBJ''' (DNA Data Bank of Japan, [http://www.ddbj.nig.ac.jp/index-e.html http://www.ddbj.nig.ac.jp/index-e.html]), '''ENA''' (European Nucleotide Archive, [http://www.ebi.ac.uk/ena/ http://www.ebi.ac.uk/ena/]), '''GenBank''' ([http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/]).

'''Worldwide Protein Data Bank''' (wwPDB) &mdash; [http://www.wwpdb.org/index.html http://www.wwpdb.org/index.html], ogólnoświatowa baza struktur molekularnych, zawierająca w lutym 2011 r. 71415 struktur, założona przez '''RCSB PDB''' ([http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do]; USA), '''PDBe''' ([http://www.ebi.ac.uk/pdbe/ http://www.ebi.ac.uk/pdbe/]; Europa) i '''PDBj''' ([http://www.pdbj.org/ http://www.pdbj.org/]; Japonia).